本校為鼓勵優秀新生就讀及幫助清寒學生就學，設置多項新生獎學金。
有鑑於每年有很多弱勢學生需要照顧，並堅持教會大學辦學的理念，發揮基督救世愛人的精神，本校提供牧羊助學計畫。
個人申請通過第一階段，填寫「長榮大學牧羊助學計畫申請表」並提供低(中 低)收入戶證明或弱勢家庭或特殊境遇家庭子女(孫子女)或 0206 震災受災 戶之證明，於第二階段甄試本校優先錄取；登記就讀志願序需以本校為第一志願，本校提供助學工讀金，學生需依本計畫接受工讀之安排。
